生物安全柜可以有效提升操作安全性和方便性，有效提升實驗人員工作效率。而且搭配上多種滅菌器等配套設施，更保證了日常應用的效果。但是應用這類安全柜需要注意以下幾個原則。
移動原則
移動安全柜時，為了避免風路狀態受到破壞，需要保持緩慢移動。而且柜內操作的過程中，實驗人員也同樣盡量保持平緩移動。
物品擺放原則
如果生物安全柜中有較多物品，為了避免出現交叉污染情況，柜內各種物品盡量保持一字掰開，而且也要避免回風中出現再次交叉污染的情況。同時要特別注意好保持正常風路，要避免擺放物品直接堵塞回風格柵。
避免震動原則
因為實驗室中難免會使用到震動類型的儀器，這樣非常容易導致柜內物品出現顆粒物震動、抖落的情況，這樣會導致內部操作的潔凈度降低，影響到實驗結果，也有可能導致不必要的一些污染。所以其余的一些設備盡量與安全柜有一定距離，不要在一個平臺上操作。
柜內移動原則
因為柜內可能會有很多不同樣品，如果同時要移動2種物品，那么一定要先將低污染物向高污染物移動的方式進行移動，這樣在移動的過程中就可以避免出現大面積污染，而且同樣也要保證緩慢移動。
建議還是應該由專業人員操作生物安全柜，應用過程中也有很多細節需要注意。一旦出現大面積污染情況，要及時解決，否則也有可能留下安全隱患。
