浮游菌采樣器廣泛應用于制藥、生物制品、保健品、飲料、醫院等行業的滅菌車間、實驗室、手術室等，浮游菌采樣器采用菌落法測定空氣中的細菌數。物體表面微生物測試可以確定物體（包括工作服）表面微生物的污染程度。一般情況下，可以使用棉簽間接取樣后培養、直接接觸法取樣和表面沖洗法3種方法，而利用直接接觸法時，所用的接觸碟要放置至室溫后使用。
1、棉簽擦拭表面取樣方法
棉簽擦拭表面取樣方法的取樣面積一般為25cm2，人體表面擦拭至少應包括雙手手指印、頭、口罩、肩部、前臂、手腕和腿等。棉簽間接取樣適用于不規則表面，取樣時，手握住拭子柄，以30°角與取樣表面接觸，采用S型或Z型緩慢并旋轉棉簽充分擦拭。如果拭子頭為藻酸鈣材料，則要用稀鹽酸溶液作為稀釋劑（比如質量分數為1%的檸檬酸鈉溶液），這樣才能讓拭子頭*溶解。
2、直接接觸法
直接接觸法是將接觸碟直接接觸需采樣的物體表面，接觸時間一般在10s左右，培養后便會長出菌落。因為該方法容易操作而且可以定量，所以，被廣泛使用。但是，這個測試只適用于平整光滑的表面，通常在灌封或灌裝后清場前取樣。取樣后，需用蘸有質量分數為75%的乙醇的紗布擦拭被取樣表面，以除去殘留。將取樣后并做好標記的接觸碟置于培養箱中培養，培養箱的參數一般設定在30～35℃，培養72h后計數。
3、表面沖洗法
表面沖洗法適用于監測大面積區域內表面的微生物含菌量，包括設備軌道、儲水罐等。用定量的無菌水沖洗表面，收集淋洗水，用膜過濾法計算微生物的數量。
4、風速測試
檢測生產過程中的風速，使生產環境的風速符合指導值（0.36～0.54m/s），同時，還可以判斷層流是否開啟、是否正常運行、是否被堵或泄漏，使生產環境達到要求。目前，由于安裝的隔離器密閉性良好，所以，經過相應的驗證，也可以適當地降低層流風速。部分文獻指出，可以選擇正壓無菌紊流的流型，不一定都要選擇層流流型。
5、隔離操作器手套的檢測
目前，檢測手套時一般采用完整性檢測，對其內部施加一定的壓力，在規定時間內，壓力降低值在可接受范圍內即視為合格。另外，還可以在每個班次生產前后，增加手套目檢程序等。檢測周期要根據產品的特點、設備和班次安排等因素驗證得出。
